אפל הגישה את ערעורה לבית המשפט האירופי לערעורים, והכריזה כולה כי החלטת הנציבות האירופית לגבות מסים של 14 מיליארד דולר מאפל בשם האיחוד האירופי היא שגויה, נוגדת את שלטון החוק, ויש לבטלה.
14 נקודות הערעורשהוצג על ידי אפלביום שני, ודווח לאחר מכןעַל יְדֵיפטנטים של FOSS, קרא תיגר על הנציבות האירופית (EC) בכמה חזיתות. בראש ובראשונה, אפל מתווכחת כי מטה קורק, אירלנד, של האגף האירופי של אפל הוקם כהלכה, בהתאם לכל התקנות והחוקים.
בנוסף, הועלו טעויות חשבונאיות אחרות לכאורה של ה-EC בעת קבלת החלטתה. אפל מציינת כי ההכנסה החייבת המיוחסת לסניף אירלנד נשלטה הוחלה באופן שגוי, והעניקה לפעילות האירית משקל רב יותר מכפי שהיה צריך, וכי הוחל מיסים חוזרים על רווחים ברחבי העולם.
אפל גם מציינת שביצוע השוואות להסדרי מס אחרים באיחוד האירופי עם חברות רב-לאומיות אחרות אינו ראוי, שכן העובדות והחוקים שונים מהסכם להסכם. ככזה, אפל טוענת שהשימוש בהם במאבק משפטי בנושא מסים אינו הולם ופוגע בצורה בלתי הוגנת לאפל.
כמו כן, מספר נקודות ערעור טוענות כי לא ניתנה לאפל הזדמנות להגנה ראויה, לא הורשה להציג ראיות מספיקות כדי להתגונן, והתעלמו מהכמות הקטנה של חוות דעת מומחים שאפל הייתה רשאית להביא לידי ביטוי לפני ההחלטה. נדחתה על ידי הנציבות האירופית על הסף בעת קבלת ההחלטה.
אפל מבקשת ביטול מוחלט של ההחלטה המחייבת תשלום של 14 מיליארד דולר, ודורשת החזר עלויות ההגנה על עצמה מה-EC.
החקירה בענייני המס של אפל באירלנד הסתיימה באוגוסט 2016, כאשר הנציבות טענה ששיעורי המס על הרווחים האירופיים של אפל היו נמוכים באופן בלתי חוקי, עד ל-0.005% ב-2014 ו-1% ב-2003. אירלנד הואשמה בהענקת "הטבות מס לא חוקיות" ל אפל, ו"הונדסה לאחור" תוך כדי כדי להבטיח חיוב מס מינימלי ככל שהזמן מתקדם.
גם אפל וגם אירלנד מתחרות על פסק הדין, עם ממשלת אירלנד "לא מסכים ביסודו" עם הממצאים והתנגדות להחזרי מס. אפל טוענת שהאיחוד האירופי "נקט בפעולה חד-צדדית ושינה את הכללים, תוך התעלמות של עשרות שנים של חוקי המס האירי, חוקי המס בארה"ב, כמו גם קונצנזוס עולמי על מדיניות מס".
בדצמבר, מנכ"ל אפל טים קוק ומנהלים בכירים אחרים היומוזמן לאירלנדלדון בפסיקה ובפעולה העתידית. לְבַשֵׁלסירב להשתתף, כאשר אפל מצטטת את המורכבות המשפטית של המקרה שמאחורי סירובו, מהלך שפוליטיקאים אירים ראו בו כ"נוזל לעם האירי".
מוקדם יותר החודש, התברר שאירלנד עשתה זאתהוציא 1.8 מיליון יורו(1.9 מיליון דולר) על עלויות משפטיות בתיק עד כה, כולל העלויות בסך 1 מיליון דולר (1.06 מיליון דולר) שדווחו בתחילת אוקטובר. הרוב פנה לעורכי דין המייצגים את אירלנד בתיק, כאשר PwC Belgium קיבלה סך של 595,400 יורו (632,200 דולר) שכר טרחה.
על פי הערכות, תהליך הערעור המלא עשוי להימשך ארבע עד חמש שנים, כאשר יועץ המס האירי PwC Feargal O'Rourke בטוח בפסיקהעלול להתהפך.