מספר אתרים מתחילים להשיק תמיכה ב-Apple Pay באינטרנט, המאפשרת למשתמשי iOS 10 לשלם עבור סחורות ושירותים הרחק מאפליקציות ומסופי נקודות מכירה.
שירות האתר Squarespace הפעיל תמיכה בטכנולוגיה בחלונות ראווה מתארחים, כל עוד הם משתמשים ב-Stripe כ-backend ומפעילים את זרימת התשלום החדשה של Squarespace. אכן מספר שירותי קצה - ביניהם Stripe, Big Commerce ו-Shopify - הכריזו בנפרד על תאימות ל-Apple Pay.
חלק מהסוחרים המציעים תמיכה באינטרנט כוללים את אתר קישוט הבית Wayfair ו-Time Inc., שנותן לאנשים לשלם עבור מנויי מגזינים כולל מותגי משנה כמושבועי בידורוספורטס אילוסטרייטד.
הבאת Apple Pay לאינטרנט אמורה בתיאוריה להוריד את החסמים לאימוץ, שכן בעוד שלעסקים רבים יש אתרים, מספר קטן יותר מוכן לשלם עבור פיתוח אפליקציות או מערכות קמעונאיות משודרגות, אם יש להם נוכחות קמעונאית בכלל. אפילו עסקים שיש להם אחד או שניהם עשויים לרצות תמיכה באינטרנט כדי לתפוס קונים בכל מקום שבו הם עשויים להיות מוכנים לקנות.
נכון לעכשיו, שימוש ב-Apple Pay באינטרנט דורש לפחות אייפון 6, אייפד פרו, אייפד אייר 2 או אייפד מיני 3. הטכנולוגיה תעבוד גם עם macOS Sierra -השקה ב-20 בספטמבר- אך המשתמשים עדיין יצטרכו לאמת את העסקאות הללו עם אייפון או Apple Watch נפרד.