נראה שאפל נוקטת עמדה קשה יותר נגד מפתחים המשתמשים בגופן האימוג'י המותאם אישית שלה, המכונה Apple Color Emoji, אפילו במקרה של אפליקציות שמשתמשות באומנות במשך שנים.
אפליקציית מסרים לעסקיםרָפוּיהשתמש באימוג'י של אפל בכל הפלטפורמות עד יום שלישי, ושל פייסבוקוואטסאפרק לאחרונה עבר לאמוג'י מותאם אישית באנדרואיד,לְפִי אמוג'יפדיה. אפל לוקחת חלק מאפליקציות iOS למשימה, ודוחה כותרות מחנות האפליקציות אם הן משתמשות באימוג'י שלה בסמלי לוגו, כפתורים, מדבקות ועוד כמה צורות תוכן מחוץ לכל שדות הזנת טקסט המסתמכים על מקלדת iOS המקורית.
אזורים אפורים כוללים דברים כמו התראות, מקלדות אימוג'י מותאמות אישית וטקסט לא אינטראקטיבי. במקרה האחרון, סוקרים של App Store אומרים שהם לא עקביים בדחייה שלהם.
בעוד שהאימוג'י בדרך כלל קשור ל-Unicode - כלומר סמיילי שהוקלד באייפון עדיין יופיע כסמיילי ב-Mac, טלפון אנדרואיד או Windows PC - לפלטפורמות שונות יש עיבודים שונים. אפל מסירה אפליקציות iOS בשל הפרת סימנים מסחריים וזכויות יוצרים.
אפל הפכה יותר ויותר את האימוג'י למרכז של עדכוני אפליקציות, ואפילו חומרה, הודות לתמיכה ב- "animoji" ב-אייפון X. האביב הזהעדכון iOS 11.3יוסיף ארבעה אנימוג'י חדשים: דרקון, דוב, גולגולת ואריה.